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Objectif et Plateforme
- Le but du cours est d'apprendre aux étudiants, à analyser des données biologiques à l'aide du langage libre: R.
- Le cours est typiquement composé de 4 séances présentielles de 2h en pour la partie théorique et de 4 séances distancielles de 4h pour la partie pratique.
- Il n'y a rien à installer car les logiciels sont sur notre serveur RStudio accessible depuis n'importe quel navigateur web, mais il peut être utile d'installer une version du logiciel (gratuit) sur votre ordinateur.
- Les serveurs et forums sont suivis pendant les heures de cours prévues dans l'horaire. En dehors de ces heures (et en particulier en dehors des jours ouvrables), un fonctionnement continu n'est pas garanti (risque accru de latences, d'interruptions de service,...).
- Il faut un mot de passe pour accéder aux matériels de cours (videos - pdf - exercices). Ce mot de passe est donné lors du premier cours et/ou est disponible sur le forum ecampus (my.uliege) du cours (sinon vous pouvez contacter l'assistant du cours: bioinformatics@uliege).
- En plus des séances en présentiel, les forums ecampus permettent de poser des questions sur le cours, exercices et organisations d'interro et examens.
Dispenses
- Les dispenses ne sont pas accordées pour le cours de STAT0077 même si vous avez déjà eu un cours de R dans votre formation précédente.
- Pour le cours d'OCEA0224, les dispenses de cette partie du cours sont occasionnellement accordées lorsqu'un cours suffisamment similaire a été réussi précédemment (il faut alors envoyer un email avec les justificatifs: table des matières, points obtenus,... au professeur).
Interros - Projets - Examens
- En général, une interro d'année est organisée afin de se familiariser avec les outils d'évaluation et de se préparer à l'examen. Typiquement:
- elle dure 2 heures: 4 questions (1 question par seance pratique)
- elle doit être le fruit d'un travail individuel
- elle prend place en distanciel après que toutes les séances de cours et d'exercices aient été données (cf CELCAT)
- 0/+1 sur chacune des 4 questions
- sa correction est automatisée (QCM, texte à encoder,...)
MAIS les réponses fournies ne sont prises en compte que si le code R est joint aux questions
- elle compte pour 4 points sur 20 (soit 20%) de la session de janvier se joue a l'interro
- elle ne compte pas pour la 2e session
- Typiquement pour l'examen:
- Les questions sont calquées sur l'interro (4 questions en 2h)
MAIS ce n'est pas un copier-coller de l'interro, il s'agit d'autres questions prises dans le même pool de difficulté, ce qui nécéssite la compréhension des concepts statistiques introduits au cours et la maitrise du langage R acquise pendant les exercices pratiques
- Elle prend place en présentiel dans une salle informatique (il faut se munir du mot de passe uliege)
- C'est un travail individuel (pas d'outils externes au serveur et à ecampus)
- Elle compte pour 16 points sur 20 en premiere session (cad 4 points par question) et 20 points en seconde session (cad 5 points par question)
- La correction est semi-automatique car le code R est pris en compte
Outils informatiques
Le materiel du cours
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